有的公司所在行業比較特殊，無法使用一般的ERP系統，因此找廠商來開發定制化系統，那么，有哪些需要注意的事項？
要定制化ERP，初期最重要的就是把需求、工作流程弄清楚，然后整理文件和廠商溝通。中期則要盡量測試細部功能，盡可能地把所存在的漏洞找出來。而后期的重點，則在整體作業流程測試上。
公司的作業都有一定的流程，例如，從訂貨到出貨，總有個流程要走。這些大流程中，還包含了其它細部的流程，像是檢查、出貨流程等。把使用者的需求轉化成流程，然后與廠商雙邊檢驗。做為使用者與廠商的橋梁，就是公司IT人員在定制化系統時的工作，因為既懂公司的流程，也懂IT。
定制化ERP，本來就應當以符合公司作業需求為原則。而廠商有其專業，在溝通時也要尊重。因此負責定制化的重點，就是要規劃、協調需求與雙方專業，達到一個平衡。不過前提當然還是以最接近公司的需求為首要條件，不然就失去定制化的意義了。
既然確定定制化，當然要依照需求為重，不過IT廠商的經驗也必須要尊重，因為他們通常經歷許多不同的客戶，累積的經驗對系統開發也都有參考價值。當然，也有可能遇到廠商開發不出來，而有“外行充內行”的現象，這就需要在簽訂合約前，多比較幾家廠商。
根據以前的經驗，需要注意的地方有下列幾點：
1. 公司組織要明確，包含主管層級、各種工作承辦人員、制度等。
2. 確認“老板”是誰？給IT的支持度是否足夠？
3. 每個部門都要有“信息化”負責人，必要時配合信息部門運作，例如流程、需求確認和參與會議，要跳過該部門經理，隨時都能配合運作。
4. 要仔細規劃計劃的方向、范圍，由大開始到小去規劃。
5. 切割流程區塊，最后把這些整合成為一個系統。
如果大部分客戶只能提出切身面臨的需求，無法提出完整的細節數據，有時連流程也不清楚。若想要和廠商合作順利，也有幾點建議：
1. 整理完整的需求。
2. 尋找廠商時，先評估廠商的軟件與能力。
3. 請合適的廠商，依需求提出關聯流程與報價。
4. 與最佳廠商簽約合作。